HPLC级乙腈主要的用途是作溶剂。如作为抽提丁二烯的溶剂，合成纤维的溶剂和某些特殊涂料的溶剂。在石油工业中用于从石油烃中除去焦油、酚等物质的溶剂。在油脂工业中用作从动植物油中抽提脂肪酸的溶剂，在医药上用于甾族类的再结晶的反应介质。也用作酒精的变性剂。此外，还可以用于合成乙胺、乙酸等，并在织物染色、照明工业中也有许多用途。
HPLC级乙腈的水体系现象：
在乙腈和水构成的均匀透明溶液中，加入适量的无机盐或有机盐，就会看到乙腈与水之间的相分离现象。由于乙腈的密度比水的密度小，因此上相为富乙腈相（含少量水），下相为贫乙腈相（主要为水）。
这种由盐诱导的乙腈相分离现象被称为乙腈的盐析现象。盐的加入产生强烈的水化作用，盐束缚了更多的水分子，使本来能与乙腈相互作用的自由水分子数目显著下降，从而产生相分离现象。通过这样的办法可以将本来溶解在水相中的物质在相分离过程中而被萃取到富乙腈相中，这样的萃取方法被称作乙腈盐析萃取法。
作为相分离引发剂的盐主要有：氯化钠、氯化钙、硫酸锌、硫酸铵、高氯酸四丁基铵等，盐的种类会影响萃取回收率。需要指出的是，能够在盐的诱导下在原本与水互溶的溶液中产生相分离的有机溶剂，不单单局限于乙腈，像乙醇、异丙醇、丙酮等也都有这样的性质。
